hi,
das sollte soweit eigentlich recht gut klappen. Ich denke mal du bringst auch schon einiges an löterfahrung mit, dann ist es eigentlich nur noch Zeitaufwand.
Das Laufwerk ist mit dem Mainboard nur über einen steckverbinder verbunden, den müsstest du dann nur entfernen und beides direkt per Kabel verbinden.
Für die belüftung wär es wahrscheinlich am schönsten, wenn du den Lüfter unten montierst und die Heckscheibe einschlitzt. Der Lüfter könnte so die kalte Luft von unten ansaugen und an der Heckscheibe wieder auslassen, dazwischen müsstest du dann ggf auch einen anderen Kühlkörper montieren.
Bei der lackierung würde ich zu was schlichtem tendieren... ein schönes bordeaux rot, dunkles metallic blau oder metallic schwarz wären schön... aber auch was knalliges wär nett, wie ein signal orange oder ein schönes gelb.